財政部中區國稅局表示，實施營利事業房地合一課徵所得稅至今，仍有營利事業因不諳法令或疏忽，未依規定申報致遭補稅甚至處罰，為提醒營利事業正確申報，特別整理常見錯誤態樣如下：
一、營利事業（不包含獨資、合夥組織之營利事業）110年7月1日以後交易符合所得稅法第4條之4規定之房屋、土地、房屋使用權、預售屋及其坐落基地暨股份或出資額，未依規定填寫營利事業所得稅結算申報書第C1-1頁中分開計稅之交易所得或損失（即第C1-1頁A欄），按規定稅率分開計算應納稅額（即第C1-1頁G欄）後，再將交易所得(或損失)及稅額，分別填入申報書第1頁損益及稅額計算表第134欄自營利事業所得額中減除及第135欄分開計稅合併報繳。
二、營利事業以自有土地與其他營利事業合作興建房屋，出售土地應填申報書第C1-1頁計算交易所得或損失，依所得稅法第24條之5第2項第1款第5目規定，不併計營利事業所得額，應將該土地交易所得按稅率20%分開計算應納稅額。實務上仍有營利事業誤將前開出售土地利益，併計營利事業所得額，如因加計後課稅所得額為負數，致短繳應自行繳納稅款。
三、營利事業購入中古屋整修後出售，應填申報書第C1-1頁計算交易所得或損失，依所得稅法第24條之5第2項第1款第1目至第3目規定，應按持有期間（2年以內、超過2年未逾5年、超過5年）適用差別稅率（45%、35%、20%）分開計算應納稅額。營利事業誤認適用同法條第4項規定興建房屋完成後第一次移轉情形，而填報申報書第C1-2頁，並將該出售房地利益併計營利事業所得額，適用20%稅率，以致短繳應自行繳納稅款。
四、營利事業出售不動產，依營利事業所得稅查核準則第24條之2規定，所得歸屬年度之認定，應以所有權移轉登記日期為準。建設公司與地主合作興建房屋，未於所有權移轉登記日之當年度，列報該房屋收入、成本及費用並認列損益，致漏報所得額。
五、營利事業出售105年1月1日後所取得之土地，該土地交易所得應依所得稅法第4條之4房地合一(新制)課徵所得稅。惟營利事業仍將前開出售土地利益，列報於當年度營利事業所得稅結算申報書第1頁101欄「免徵所得稅之出售土地利益」項下減除，除依法調整補稅外，尚須依所得稅法第110條規定處罰。
該局提醒，營利事業應依規定設帳並按帳證紀錄計算所得額申報納稅，其興建房屋過程及出售房地之交易，須記錄相關投入成本及費用支出，以確知自身營運狀況及獲利情形。
資料來源：整理摘錄自財政部新聞稿