財政部臺北國稅局表示，個人以適用房地合一稅制之土地（下稱新制土地）與營利事業合建分屋，如實際分回房地價值等於可選配價值，於房地交換時，免報繳房地合一稅，惟日後出售分回房地之成本，應以合建前土地之原始取得成本為準，尚不得將營利事業於房地互易時開立統一發票所載含稅銷售價格（下稱互易發票金額）計入。
該局進一步說明，個人以新制土地與營利事業合建分屋，如實際分回房地價值高於可選配價值而給付差額價金，於房地交換時，免報繳房地合一稅，嗣出售分回房地，其原始取得成本之計算，應以合建前土地之取得成本加計給付價金認定；如實際分回房地價值低於可選配價值而收取差額價金，該差額價金核屬出售參與合建之部分土地，於房地交換時，應報繳房地合一稅，嗣出售分回房地，其原始取得成本之計算，應以合建前土地之取得成本扣除所收取價金部分之金額認定。
該局舉例說明，納稅人甲君於105年12月間以700萬元買賣取得A地，嗣以A地與營利事業合建並分回B房地（實際分回房地價值等於可選配價值），甲君於111年1月間以2,400萬元出售B房地時，誤以A地原始取得成本700萬元加計互易發票金額750萬元列報房地合一稅之取得成本為1,450萬元，經該局減除互易發票金額750萬元，並以甲君於合建前A地之原始取得成本700萬元認定B房地交易成本，按A地持有期間（超過5年，未逾10年）適用稅率20%計算補徵稅額150萬元〔(申報成本1,450萬元-核定成本700萬元)x適用稅率20%〕。
該局提醒，個人以適用房地合一稅制之土地與營利事業合建分屋，嗣出售分回之房地，應特別注意房地合一稅取得成本的計算規定，以免誤列報成本，而遭稽徵機關調整補稅。
資料來源：整理摘錄自財政部新聞稿